تعد أحد أهم الدوائر بالمديرية إذ تقوم بالإشراف وتصميم ومتابعة تنفيذ المشاريع الإنمائية المعتمدة والتوسعات بأعلى معايير الهندسة المعمارية.

تقوم دائرة الصيانة بدراسة وحصر متطلبات أعمال الصيانة للمؤسسات الصحية في ضوء إختصاصاتها المعتمدة من حيث صيانة المباني، الإتصالات، معدات المكاتب، الأجهزة الكهربائية وأجهزة التبريد والتكييف بالتنسيق مع الجهات المختصة بالوزارة والعمل على تأهيلها وتطويرها.

هي الدائرة المسؤولة عن تزويد المؤسسات الصحية القائمة والجديدة بالأجهزة والمعدات الطبية الحديثة وصيانتها وإستبدالها وتطويرها بالإضافة إلى توفير سيارات الإسعاف حسب الإحتياجات الفعلية للمؤسسات الصحية.

تعمل دائرة الشئون الهندسية والفنية على حماية متلقي الخدمة العلاجية والكادر الطبي من خطر الإشعاع وذلك من خلال عمل فحوصات القبول وضبط الجودة لأجهزة الأشعة قبل تشغيلها ، كما تقوم بمراجعة المخططات الهندسية للمؤسسات الصحية الخاصة والتأكد من مدى استيفائها للشروط والمعايير المتبعة في وزارة الصحة بالتنسيق مع المديرية العامة للمؤسسات الصحية الخاصة، إضافة إلى مراجعة تصاميم منظومة الغازات الطبية في المؤسسات الصحية الحكومية والخاصة، من جهة أخرى تعنى الدائرة بمراجعة متطلبات هيئة الدفاع المدني والإسعاف لكافة المشاريع الجديدة والتوسعات والصيانات وإعتمادها من الجهة المختصة .